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(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202111613484.3 (22)申请日 2021.12.27 (66)本国优先权数据 202110930268.5 2021.08.13 CN (71)申请人 上海鑫湾生物科技有限公司 地址 201506 上海市金山区豪业路518号6 幢 (72)发明人 徐建青 张晓燕 廖启彬 丁相卿 (74)专利代理 机构 北京泛华伟业知识产权代理 有限公司 1 1280 代理人 郭广迅 (51)Int.Cl. C07K 14/47(2006.01) C12N 15/12(2006.01) C12N 15/867(2006.01)C12N 15/67(2006.01) C12N 5/10(2006.01) A61K 39/00(2006.01) A61K 35/17(2015.01) A61P 35/00(2006.01) (54)发明名称 缺氧触发的人工转录因子、 转录控制系统及 其应用 (57)摘要 本发明提供了一种缺氧触发的人工转录因 子。 本发明还提供了一种缺氧触发的转录控制系 统, 所述转录控制系统包含编码HATF的核 酸序列 和RE。 根据本发明所述的缺氧触发的转录控制系 统, 其中所述缺氧触发的转录控制系统包括上下 游连锁的两套转录控制单元, 其中所述上游转录 控制单元包含用于控制HATF的缺氧触发的转录 反应元件和编码HATF的核 酸序列; 所述下游转录 控制单元包含RE和目的基因。 本发明的人工转录 因子HATF和识别元件RE联合调控目的基因的放 大倍数可达百倍, 远优于传统人工转录因子 (GAL4)及其反应元件(UAS)的10倍上调。 权利要求书3页 说明书12页 序列表9页 附图6页 CN 114249807 A 2022.03.29 CN 114249807 A 1.一种缺氧触发的人工转录因子 HATF, 所述HATF包 含: (1)SEQ ID NO:1所示的序列; (2)与SEQ ID NO:1所示的序列相比具有一个或几个氨基酸的置换、 缺失或添加的序 列; 或 (3)与SEQ ID NO:1所示的序列具有至少80%、 至少85%、 至少90%、 至少91%、 至少 92%、 至少93%、 至少94%、 至少95%、 至少96%、 至少97%、 至少98%、 至少99%、 或100%的 序列同一 性的序列。 2.编码如权利要求1所述的HATF的核酸序列。 3.如权利要求1所述的HATF的识别元件RE, 所述RE包 含选自以下的核心序列: (1)SEQ ID NO: 2所示的序列, 或其互补序列; (2)在严格杂交条件下与SEQ ID NO: 2所示的序列杂交的序列; (3)与SEQ ID NO: 2所示的序列具有至少85%、 90%、 91%、 92%、 93%、 94%、 95%、 96%、 97%、 98%、 98.5%、 9 9%或99.5%序列同一 性的序列; 或 (4)由通过缺失、 取代、 插入或增加一个或多个核苷酸而衍生化SEQ ID NO: 2所示的序 列获得的序列; 优选地, 所述RE包含所述核心序列的多个拷贝和最小启动子; 更优选地, 所述多个拷贝 为两个拷贝、 三个拷贝、 四个拷贝、 五个拷贝、 六个拷贝、 七个拷贝、 八个拷贝、 九个拷贝或十 个拷贝; 进一步优选地, 所述识别元件RE包含所述核心序列的五个或六个拷贝和最小启动 子; 更进一步优选地, 所述RE包 含选自以下的序列: (1)SEQ ID NO: 3所示的序列, 或其互补序列; (2)在严格杂交条件下与SEQ ID NO: 3所示的序列杂交的序列; (3)与SEQ ID NO: 3所示的序列具有至少85%、 90%、 91%、 92%、 93%、 94%、 95%、 96%、 97%、 98%、 98.5%、 9 9%或99.5%序列同一 性的序列; 或 (4)由通过缺失、 取代、 插入或增加一个或多个核苷酸而衍生化SEQ ID NO: 3所示的序 列获得的序列; 最优选地, 所述RE如SEQ ID NO: 3所示。 4.一种缺氧触发的转录控制系统, 所述转录控制系统包含如权利要求2所述的核酸序 列和如权利要求3所述的RE; 优选地, 所述缺氧触发的转录控制系统包括上下游连锁的两套转录控制单元, 其中所 述上游转录控制单元包含用于控制HATF的缺氧触发的转录反应元件HRTE和编码HATF的核 酸序列; 所述下游转录控制单 元包含RE和目的基因G OI。 5.根据权利要求4所述的缺氧触发的转录控制系统, 其中, 所述上下游连锁的转录控制 单元非线性串联, 位于 两个载体; 优选地, 所述 转录控制系统具有如下式 中任一项所示的组合形式: HATF‑HRTE和RE ‑GOI; HATF‑HRTE和GOI‑RE; HRTE‑HATF和GOI‑RE或 HRTE‑HATF和RE ‑GOI;权 利 要 求 书 1/3 页 2 CN 114249807 A 2或所述上 下游连锁的转录控制单 元线性串联, 位于同一载体; 优选地, 所述 转录控制系统具有如下式 中任一项所示的组合形式: HATF‑HRTE‑RE‑GOI; HATF‑HRTE‑GOI‑RE; HRTE‑HRE‑GOI; HRTE‑HATF‑GOI‑RE; RE‑GOI‑HATF‑HRTE; RE‑GOI‑HRTE‑HATF; GOI‑RE‑HATF‑HRTE或 GOI‑RE‑HRTE‑HATF。 6.根据权利要求4或5所述的缺氧触发的转录控制系统, 其中, 所述HRTE选自缺氧诱导 基因的部分序列; 优选地, 所述HRTE选自血管内皮生长因子基因、 红细胞生成素基因、 糖酵 解酶基因的侧翼区; 更优选地, 所述HRTE的核心序列为5 ’ ‑(A/G)CGT(G/ C)‑3’; 优选地, 所述HRTE包 含选自以下的核心序列: (1)SEQ ID NO: 4所示的序列, 或其互补序列; (2)在严格杂交条件下与SEQ ID NO: 4所示的序列杂交的序列; (3)与SEQ ID NO: 4所示的序列具有至少85%、 90%、 91%、 92%、 93%、 94%、 95%、 96%、 97%、 98%、 98.5%、 9 9%或99.5%序列同一 性的序列; 或 (4)由通过缺失、 取代、 插入或增加一个或多个核苷酸而衍生化SEQ ID NO: 4所示的序 列获得的序列; 优选地, 所述HRTE包含所述核心序列的多个拷贝和最小启动子; 更优选地, 所述多个拷 贝为两个拷贝、 三个拷贝、 四个拷贝、 五个拷贝、 六个拷贝、 七个拷贝、 八个拷贝、 九个拷贝或 十个拷贝; 进一 步优选地, 所述HRTE包 含所述核心序列的五个或六个 拷贝和最小启动子; 更进一步优选地, 所述HRTE包 含选自以下的序列: (1)SEQ ID NO: 5所示的序列, 或其互补序列; (2)在严格杂交条件下与SEQ ID NO: 5所示的序列杂交的序列; (3)与SEQ ID NO: 5所示的序列具有至少85%、 90%、 91%、 92%、 93%、 94%、 95%、 96%、 97%、 98%、 98.5%、 9 9%或99.5%序列同一 性的序列; 或 (4)由通过缺失、 取代、 插入或增加一个或多个核苷酸而衍生化SEQ ID NO: 5所示的序 列获得的序列; 最优选地, 所述HRTE如SEQ ID NO: 5所示。 7.根据权利要求4至6 中任一项所述的缺氧触发的转录控制系统, 其中, 所述GOI选自 以 下的一种或多种: 细胞因子和趋化因子, 优选选自GM ‑CSF、 IFN‑α /β /γ、 IL ‑2、 IL‑3、 IL‑7、 IL‑12、 IL‑15、 IL‑21、 IL‑33、 IL‑35、 IL‑37、 CCL4、 CCL20、 CXCL9、 CXCL10、 CXCL11、 CXCL12、 CXCL13、 MIP ‑1α 或 MIP‑1β; 细胞毒性分子, 优选选自TNF ‑α、 针对不同抗原靶标的T细胞衔接子、 针对不同抗原靶标 的嵌合抗原受体、 凋亡基因、 焦亡基因或毒素; 针对不同抗原靶标的激动型抗体, 优选选自抗CD28抗体、 抗4 ‑1BB抗体、 抗ICOS抗体、 抗权 利 要 求 书 2/3 页 3 CN 114249807 A 3
专利 缺氧触发的人工转录因子、转录控制系统及其应用
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